62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2479 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  100 
 
 		 88 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  51.95 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  45.12 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  45.68 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  44.87 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  44 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  47.37 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  42.47 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  42.65 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3354  hypothetical protein  46.27 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.175891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  40.48 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3575  hypothetical protein  46.27 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3668  hypothetical protein  46.27 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3263  hypothetical protein  42.67 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.446998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  40.48 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3568  hypothetical protein  44.12 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.641066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1649  hypothetical protein  44.78 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3318  hypothetical protein  44.12 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3585  hypothetical protein  44.78 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3268  hypothetical protein  44.78 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0756935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  36 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  34.18 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0636  hypothetical protein  34.52 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2657  protein of unknown function DUF1294  42.03 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  36.76 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  31.25 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  32.26 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  28.21 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  28.21 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  39.68 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  35.8 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  34.38 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3615  hypothetical protein  47.27 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0577  hypothetical protein  31.82 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.773854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  35.71 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  36.21 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  25.64 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1169  hypothetical protein  37.31 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  31.34 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1338  hypothetical protein  39.74 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00413019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  33.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  37.5 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  29.09 
 
 		 134 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 120 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  32.05 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  29.85 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  30.38 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  30.99 
 
 		 238 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  28 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  21.52 
 
 		 115 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>