18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0577 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0577  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.773854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  38.16 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  45.9 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  36.36 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  37.97 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  36.14 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  36 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  32.5 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  32.84 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  36 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  34.12 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  31.34 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  31.34 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  31.34 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  34.12 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  31.34 
 
 
114 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  30.88 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>