78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2657 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2657  protein of unknown function DUF1294  100 
 
 
85 aa  173  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  58.97 
 
 
83 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  45.68 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  47.54 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  43.66 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  39.47 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1649  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  46.58 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  47.95 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  45.33 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3568  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.641066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3668  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3268  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0756935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3318  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3575  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3585  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  41.79 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3354  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.175891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3263  hypothetical protein  41.03 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.446998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  41.54 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  36.49 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  35.53 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3615  hypothetical protein  50.82 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  41.67 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  36.84 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  31.33 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  27.5 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0577  hypothetical protein  34.25 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.773854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  37.1 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  37.29 
 
 
114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  37.29 
 
 
114 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  37.29 
 
 
114 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  31.94 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  37.29 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1338  hypothetical protein  34.18 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00413019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  39.34 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  35.59 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17270  predicted membrane protein  45.16 
 
 
307 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.692872  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  31.17 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.89 
 
 
237 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  40.68 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  43.48 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  37.29 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  33.9 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  32.88 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  36.21 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  31.34 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  32.84 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  35.59 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  36.62 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2235  hypothetical protein  45.83 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  33.85 
 
 
204 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  35.59 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0699  protein of unknown function DUF1294  33.77 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  44.44 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  27.27 
 
 
209 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  27.27 
 
 
211 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  33.93 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  33.82 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0636  hypothetical protein  47.17 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  32.05 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  34.38 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  31.17 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1169  hypothetical protein  39.62 
 
 
93 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>