73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2883 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  89.53 
 
 		 172 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  91.62 
 
 		 157 aa  299  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  61.15 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  63.16 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  73.28 
 
 		 116 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  72.41 
 
 		 116 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  72.41 
 
 		 116 aa  177  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  71.55 
 
 		 116 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.64 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  46.1 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  55.75 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  56.19 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  43.85 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  42.94 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  57.5 
 
 		 204 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.27 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 		 111 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  45.8 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  48.6 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 223 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.54 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  49.17 
 
 		 204 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  52.38 
 
 		 91 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  65.62 
 
 		 120 aa  91.3  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.76 
 
 		 224 aa  87.8  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  47.42 
 
 		 116 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  52.27 
 
 		 98 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  44.53 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  46.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  48.15 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  45.77 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  38.33 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  40.94 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  45.35 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  49.43 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  45.35 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  41.41 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  49.32 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  52.86 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  48.61 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  48.19 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  55.93 
 
 		 240 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  48.19 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  46.99 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  40 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  37.21 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  43.66 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  45.31 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  47.76 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  40.35 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  43.24 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  38.64 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  37.84 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  46.34 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  38.89 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  33.75 
 
 		 94 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  41.79 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  37.33 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  40.32 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  41.27 
 
 		 90 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  31.67 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0272  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>