71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2455 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  100 
 
 
204 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  37.56 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  35.86 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.09 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  34.76 
 
 
204 aa  111  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  36.84 
 
 
204 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.58 
 
 
219 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 
237 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  32.81 
 
 
209 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  35.41 
 
 
238 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  32.81 
 
 
211 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  27.23 
 
 
207 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  29.8 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.79 
 
 
203 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  34.22 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  92  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  44.07 
 
 
142 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  43.08 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  31.61 
 
 
225 aa  88.2  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  41.41 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  39.44 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  61.43 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  43.2 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  46.23 
 
 
116 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  48.08 
 
 
116 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  50.59 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  50.59 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  53.33 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  49.38 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  53.33 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  53.33 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  40.62 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  42.5 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  53.03 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  46.25 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  50.72 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  43.53 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  48.68 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.18 
 
 
111 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  41.05 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  43.04 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  36.42 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  34.38 
 
 
114 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  36.14 
 
 
114 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  36.14 
 
 
114 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  36.14 
 
 
114 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  36.14 
 
 
114 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  40.85 
 
 
120 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  39.44 
 
 
89 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  42.86 
 
 
103 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  34.53 
 
 
164 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  28.07 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  39.56 
 
 
124 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.33 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  35.05 
 
 
120 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  34.51 
 
 
124 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  36.07 
 
 
95 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  27.78 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2791  protein of unknown function DUF1294  35.14 
 
 
100 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0469638  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  29.41 
 
 
94 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>