More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2482 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  53.2 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  48.79 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  47.21 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 237 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  40.78 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  39.15 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  41.97 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  42.79 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  35.53 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  35.53 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.11 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  37.11 
 
 		 225 aa  124  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  37.38 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  36.84 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  52.78 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  49.17 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  50.93 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  40.65 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  61.9 
 
 		 107 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  55.95 
 
 		 142 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  50.48 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  35.58 
 
 		 240 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  49.52 
 
 		 116 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  49.52 
 
 		 116 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  49.52 
 
 		 116 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  53.93 
 
 		 111 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  57.47 
 
 		 120 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  52.44 
 
 		 142 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  53.57 
 
 		 145 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  56 
 
 		 96 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  57.14 
 
 		 164 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  51.61 
 
 		 144 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  43.9 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  54.79 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  54.79 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  49.41 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  52.05 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  51.47 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  47.89 
 
 		 116 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  45.67 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  45.88 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  49.15 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  49.15 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  40.74 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  46.48 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  43.86 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  47.62 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  42.65 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  50 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  43.22 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  38.75 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  47.76 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5163  cold-shock DNA-binding domain protein  49.21 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  0.551155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3086  cold shock protein  49.21 
 
 		 67 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6292  cold-shock DNA-binding domain protein  47.62 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5433  cold-shock DNA-binding domain protein  46.03 
 
 		 67 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0949203  hitchhiker  0.00613475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  39.06 
 
 		 95 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2874  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 68 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  31.76 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2147  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 68 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.135641  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 67 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.52 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4535  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 68 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2070  cold-shock protein, DNA-binding  36.71 
 
 		 137 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  0.566807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 70 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.662229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  48.21 
 
 		 67 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  42.03 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3018  cold-shock DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 63 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000391893  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  37.5 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  30.23 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 117 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  31.65 
 
 		 91 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2638  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 63 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0531949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  35.59 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0830  cold-shock DNA-binding domain protein  32.56 
 
 		 96 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 		 92 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6033  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 69 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.263263  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.54 
 
 		 68 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  37.35 
 
 		 135 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 		 94 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  43.55 
 
 		 97 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>