190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3443 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  52.91 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  48.79 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.33 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  40.59 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  45.41 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  40.51 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  42.33 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.78 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.39 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.71 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.16 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  37.75 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  45.77 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  35 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  35 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  35.86 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  40.94 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  37.31 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  55.66 
 
 		 116 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  55.66 
 
 		 116 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  55.66 
 
 		 116 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  57.43 
 
 		 111 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  48.6 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  62.34 
 
 		 116 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  46.4 
 
 		 142 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  58.02 
 
 		 107 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  35.41 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  47.67 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  39.67 
 
 		 134 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  51.25 
 
 		 91 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  50 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  55.42 
 
 		 98 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  41.88 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  50.67 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  34.76 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  55.29 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  50.68 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  50.68 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  50.6 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  44 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  46.58 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  52.17 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  34.88 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  44.71 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  49.15 
 
 		 60 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  49.15 
 
 		 60 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  48.65 
 
 		 96 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  43.12 
 
 		 120 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  41.05 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  54.24 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  52.24 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  33.01 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  41.27 
 
 		 94 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  37.89 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  38.96 
 
 		 114 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 69 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3086  cold shock protein  38.71 
 
 		 67 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  33.85 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 117 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  41.46 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2176  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 69 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141033  normal  0.0176419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3257  cold-shock protein, DNA-binding  42.42 
 
 		 69 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 69 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.084577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  38.36 
 
 		 89 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6292  cold-shock DNA-binding domain protein  40.32 
 
 		 67 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5163  cold-shock DNA-binding domain protein  40.32 
 
 		 67 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  0.551155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.2 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.662229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  46.3 
 
 		 69 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3436  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5433  cold-shock DNA-binding domain protein  38.71 
 
 		 67 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0949203  hitchhiker  0.00613475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  35.59 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  42.19 
 
 		 90 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2874  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 68 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 67 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2375  cold-shock protein, DNA-binding  41.27 
 
 		 69 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2586  cold-shock DNA-binding protein family protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  39.24 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1730  cold-shock DNA-binding protein family protein  35 
 
 		 71 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4644  cold-shock DNA-binding protein family protein  33.85 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5022  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 69 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.499823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1283  cold-shock DNA-binding domain protein  35 
 
 		 70 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2147  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.135641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4329  hypothetical protein  39.62 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208733 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5339  cold-shock DNA-binding protein family protein  33.85 
 
 		 71 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2024  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.62 
 
 		 68 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>