32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2791 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2791  protein of unknown function DUF1294  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0469638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  36.59 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  35.9 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  40.23 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  41.43 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  39.77 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  39.02 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  40.54 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  35.37 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  40 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  40 
 
 		 211 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  39.51 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  35.37 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  47.17 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  52.27 
 
 		 240 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  42.03 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  34.48 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  41.25 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  38.14 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  39.47 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  39.66 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  41.51 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  41.38 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  30.68 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>