123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17270  predicted membrane protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.692872  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2666  hypothetical protein  43.67 
 
 
280 aa  185  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.490325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15680  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 
236 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3629  hypothetical protein  37.45 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.267254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2125  hypothetical protein  37.65 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2871  hypothetical protein  31.78 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3185  hypothetical protein  33.76 
 
 
236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3163  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.964275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3182  hypothetical protein  33.47 
 
 
236 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0937761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2954  hypothetical protein  31.4 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.032599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3178  hypothetical protein  31.4 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0814  hypothetical protein  33.64 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3191  hypothetical protein  36.99 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2933  hypothetical protein  31.22 
 
 
236 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0694747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2907  hypothetical protein  32.09 
 
 
232 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2077  hypothetical protein  37.57 
 
 
236 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1544  hypothetical protein  40.1 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0521  hypothetical protein  33.19 
 
 
236 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0227  hypothetical protein  37.99 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482359  normal  0.182305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0092  hypothetical protein  38.76 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1499  hypothetical protein  35.43 
 
 
247 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0226189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0107  hypothetical protein  38.78 
 
 
323 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2249  hypothetical protein  36.59 
 
 
253 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0862761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04620  hypothetical protein  38.31 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2395  hypothetical protein  36.26 
 
 
252 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36760  hypothetical protein  37.14 
 
 
277 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1019  hypothetical protein  38.33 
 
 
259 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  0.277845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3758  hypothetical protein  34.46 
 
 
280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  59.32 
 
 
70 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  48.15 
 
 
90 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  42.39 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  37.8 
 
 
94 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3318  hypothetical protein  53.52 
 
 
82 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3568  hypothetical protein  53.52 
 
 
82 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.641066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  43.75 
 
 
92 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3575  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3668  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1649  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3268  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0756935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3354  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.175891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3585  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3263  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.446998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  47.56 
 
 
90 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  47.14 
 
 
96 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  55 
 
 
92 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  39.19 
 
 
93 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  38.55 
 
 
91 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  37.66 
 
 
88 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  47.89 
 
 
83 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46456  predicted protein  30.81 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  39.24 
 
 
91 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  43.86 
 
 
88 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  42.47 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  35.23 
 
 
207 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3615  hypothetical protein  54.24 
 
 
66 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  38.75 
 
 
179 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  46.88 
 
 
114 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  41.79 
 
 
201 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.9 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.96 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  41.56 
 
 
87 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  37.8 
 
 
87 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  30.93 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  50 
 
 
96 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  45.31 
 
 
114 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  45.31 
 
 
114 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  45.31 
 
 
114 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  43.06 
 
 
135 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  42.65 
 
 
89 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  43.75 
 
 
114 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  44 
 
 
107 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  44 
 
 
111 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  38.75 
 
 
116 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  38.75 
 
 
116 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  38.75 
 
 
116 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2657  protein of unknown function DUF1294  41.67 
 
 
85 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  37.18 
 
 
116 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  46.77 
 
 
103 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  37.5 
 
 
116 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0272  hypothetical protein  47.76 
 
 
87 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  40.7 
 
 
157 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  40.54 
 
 
167 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2235  hypothetical protein  58.33 
 
 
82 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  39.53 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  46.67 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  34.88 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1338  hypothetical protein  41.25 
 
 
91 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00413019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  39.73 
 
 
206 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  40.58 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  45 
 
 
142 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  44.64 
 
 
115 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.3 
 
 
205 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  45.9 
 
 
80 aa  48.9  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  48.08 
 
 
120 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.26 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  40.58 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  36.49 
 
 
98 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>