38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1499 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1499  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0226189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2249  hypothetical protein  51.77 
 
 
253 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0862761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0814  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0092  hypothetical protein  35.21 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17270  predicted membrane protein  34.98 
 
 
307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.692872  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3629  hypothetical protein  35.32 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.267254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2125  hypothetical protein  31.45 
 
 
265 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0107  hypothetical protein  41.48 
 
 
323 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2666  hypothetical protein  37.61 
 
 
280 aa  122  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.490325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0227  hypothetical protein  35.94 
 
 
310 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482359  normal  0.182305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15680  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
236 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1544  hypothetical protein  38.38 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2077  hypothetical protein  32.02 
 
 
236 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3191  hypothetical protein  31.74 
 
 
236 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2933  hypothetical protein  32.16 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0694747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3182  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0937761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3178  hypothetical protein  30.87 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2954  hypothetical protein  30.87 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.032599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3185  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2871  hypothetical protein  28.51 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2907  hypothetical protein  30.22 
 
 
232 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3163  hypothetical protein  33.16 
 
 
236 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.964275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0521  hypothetical protein  32.97 
 
 
236 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36760  hypothetical protein  36.61 
 
 
277 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1019  hypothetical protein  36.81 
 
 
259 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  0.277845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04620  hypothetical protein  36.84 
 
 
257 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3758  hypothetical protein  36.42 
 
 
280 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2395  hypothetical protein  30.19 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46456  predicted protein  29.41 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695744  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49795  predicted protein  25.96 
 
 
449 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.853925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  27.78 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  28.8 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  28.8 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  28.8 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  29.37 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>