More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1668 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  93.85 
 
 
68 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0751  cold-shock DNA-binding protein family protein  92.31 
 
 
67 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.6 
 
 
67 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.6 
 
 
67 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  81.82 
 
 
67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3591  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2602  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0673828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 
67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.3 
 
 
67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.79 
 
 
67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 
67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  77.61 
 
 
67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 
67 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 
67 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 
67 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  77.27 
 
 
67 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  78.79 
 
 
67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  74.63 
 
 
68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312449  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 
68 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 
68 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 
67 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.12 
 
 
67 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 
67 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  73.13 
 
 
67 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 
83 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1002  cold-shock domain-contain protein  72.73 
 
 
67 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  106  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  73.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 
170 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0430  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000180464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3528  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00720053  normal  0.332876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  74.24 
 
 
67 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  76.56 
 
 
69 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
68 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  73.13 
 
 
81 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  73.13 
 
 
81 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
68 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0775  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150831  hitchhiker  0.000000000149768 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
67 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2438  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  71.21 
 
 
67 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2568  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000063088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
68 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
67 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
68 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 
67 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 
67 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
72 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>