More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0292 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  100 
 
 		 247 aa  513  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  86.45 
 
 		 253 aa  447  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  62.2 
 
 		 134 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.9 
 
 		 128 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.75 
 
 		 149 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.52 
 
 		 146 aa  99  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.14 
 
 		 181 aa  99  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.21 
 
 		 137 aa  98.6  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  62.82 
 
 		 146 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.33 
 
 		 134 aa  95.1  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.33 
 
 		 134 aa  95.1  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.8 
 
 		 139 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  39.86 
 
 		 146 aa  91.7  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.83 
 
 		 134 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.25 
 
 		 130 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.95 
 
 		 136 aa  86.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.84 
 
 		 146 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.03 
 
 		 143 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.88 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  49.51 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  33.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  33.77 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.88 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.69 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  45.54 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  37.68 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.19 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.62 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  51.9 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.5 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  51.04 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.16 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.13 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.09 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.35 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  38.94 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.82 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.86 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.19 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.18 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1521  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.08 
 
 		 68 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  22.45 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1759  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 103 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2874  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 68 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0662  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 70 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.662229 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5162  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 		 69 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0142  cold shock protein  43.1 
 
 		 74 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0093  cold-shock DNA-binding domain protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0078  cold-shock DNA-binding domain protein  43.1 
 
 		 69 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.176991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3148  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 71 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0858327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3615  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 84 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00635954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1312  cold-shock DNA-binding domain protein  43.75 
 
 		 64 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.632587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  25.78 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.42 
 
 		 71 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 69 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2908  hypothetical protein  43.28 
 
 		 71 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2762  hypothetical protein  43.28 
 
 		 71 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5928  cold-shock DNA-binding domain protein  43.1 
 
 		 69 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1986  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 		 64 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.320623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  41.54 
 
 		 70 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3145  Cold-shock protein DNA-binding protein  25.71 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.843099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  27.85 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2842  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 68 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1730  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.11 
 
 		 71 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1345  cold-shock DNA-binding domain protein  43.1 
 
 		 69 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  40.91 
 
 		 79 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4315  cold-shock DNA-binding domain protein  47.37 
 
 		 69 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0374104  normal  0.166197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3947  cold-shock protein DNA-binding  47.37 
 
 		 69 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.86 
 
 		 67 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2503  cold-shock DNA-binding domain protein  46 
 
 		 70 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1685  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.44 
 
 		 89 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000048024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3436  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1185  cold-shock protein DNA-binding  43.1 
 
 		 69 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3306  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.06 
 
 		 69 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  42.11 
 
 		 67 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 67 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.91 
 
 		 71 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2208  cold-shock DNA-binding domain protein  46 
 
 		 70 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4010  cold-shock protein CspD  41.54 
 
 		 88 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0979489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2344  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6591  cold-shock DNA-binding domain protein  41.38 
 
 		 69 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1364  cold-shock DNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 71 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>