59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2766 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  88.11 
 
 		 143 aa  236  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  86.71 
 
 		 143 aa  233  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.55 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.98 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  55.64 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.14 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.14 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.14 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  54.89 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.64 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.64 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.64 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.89 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  64.52 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  48.84 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.16 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.23 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.39 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.62 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.24 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.42 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.73 
 
 		 136 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  57.73 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  57.43 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.41 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.82 
 
 		 203 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  49.06 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  65.88 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  48.15 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.92 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  46.21 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.69 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.15 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.04 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.45 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.78 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 253 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.15 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.76 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  41.79 
 
 		 247 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.45 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  53.33 
 
 		 181 aa  87.8  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.04 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.51 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.89 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.62 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.96 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.73 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1583 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>