40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0658 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.06 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.77 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1933  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.36 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.73 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  42.25 
 
 		 1131 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.63 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.54 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.29 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  42.25 
 
 		 1131 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.21 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  29.61 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  29.61 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  29.61 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  47.54 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  42.65 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.54 
 
 		 143 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.54 
 
 		 143 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.54 
 
 		 143 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.08 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  35.21 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5434  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.88 
 
 		 349 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.158249 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  35.21 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.33 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.54 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.5 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.91 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  43.75 
 
 		 1583 aa  44.7  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.94 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.35 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.14 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.35 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.84 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>