16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1172 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  72.03 
 
 		 149 aa  193  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.31 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  45.28 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  46.48 
 
 		 1131 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  45.77 
 
 		 1131 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  41.88 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.1 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.45 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  38.78 
 
 		 546 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.5 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  28.1 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.29 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.5 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>