60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0858 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 
163 aa  323  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.91 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.18 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.37 
 
 
143 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.37 
 
 
143 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.37 
 
 
143 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.37 
 
 
143 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48 
 
 
139 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.28 
 
 
203 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  55.43 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.53 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  53.4 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.47 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.63 
 
 
119 aa  97.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.25 
 
 
149 aa  97.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.55 
 
 
151 aa  97.1  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.17 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.45 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  42.76 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.26 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.54 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  43.66 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.66 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  56.67 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  50 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.08 
 
 
128 aa  94.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.12 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.92 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.12 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.13 
 
 
136 aa  94  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  52.94 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.13 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.08 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.75 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.13 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  53.93 
 
 
143 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  36.21 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.42 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.91 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.19 
 
 
143 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  45.59 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.19 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.16 
 
 
253 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  53.16 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.59 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.29 
 
 
223 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  46.88 
 
 
1583 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.43 
 
 
200 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.12 
 
 
157 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.03 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.84 
 
 
306 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  46.15 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.530418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>