58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5271 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  68.42 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.68 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.35 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  70.65 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.6 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  67.37 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  67.37 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.73 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  63.83 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.31 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.79 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  59.14 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.52 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.38 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.95 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  55.32 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  55.56 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.64 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.56 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.04 
 
 		 203 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  52.63 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.7 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  47.73 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  57.14 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.33 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.47 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.97 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.54 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.95 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.31 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  58.33 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.21 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.47 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  51.11 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.27 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  38.69 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.94 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.74 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.78 
 
 		 306 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.54 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  36.49 
 
 		 1583 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.94 
 
 		 200 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>