58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6031 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.03 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.43 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.43 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.29 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  68.54 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  70.21 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  68.42 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.52 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.64 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.64 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.64 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  64.36 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  48.91 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  65.31 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.64 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.75 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.64 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.07 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.07 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  57.02 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  62.37 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.64 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.19 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.71 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  67.06 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  53.7 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  48.06 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.56 
 
 		 203 aa  110  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.46 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.45 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  61.18 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.18 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.59 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.89 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  48.39 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.63 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.89 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.68 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51 
 
 		 163 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.47 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.76 
 
 		 253 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  44.8 
 
 		 247 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  52.22 
 
 		 181 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.31 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.58 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.43 
 
 		 306 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.14 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1583 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.94 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>