56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0358 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.69 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  55.56 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  49.62 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  55.26 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.62 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.46 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.67 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.1 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.64 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.23 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  60.23 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  61.9 
 
 		 247 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.59 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  58.43 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.35 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  50.43 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.69 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  49.26 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.89 
 
 		 203 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.25 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.43 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.88 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.95 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.21 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.58 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.7 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  58.89 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  44.63 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.04 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.02 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.57 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.98 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.19 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.98 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.09 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  48.78 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.68 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.15 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.68 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.48 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1583 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.63 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>