57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2670 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  64.08 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.1 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  56.03 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  75.29 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.31 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.37 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.37 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  66.67 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.64 
 
 		 134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.05 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.83 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.2 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 253 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.3 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.45 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.68 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  62.96 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  60.47 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  42.75 
 
 		 247 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.72 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.35 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.92 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.33 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.7 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  52.73 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  56.07 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.47 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.55 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.79 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  57.14 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.72 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  55.81 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  54.84 
 
 		 181 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.55 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.63 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  56.63 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.26 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.93 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  55.42 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.18 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.22 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.28 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.16 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  32.2 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.2 
 
 		 151 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>