57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3396 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 138 aa  286  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  94.2 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  72.66 
 
 		 133 aa  197  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.89 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.81 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.81 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.81 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.81 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.96 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.96 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  62.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  59.03 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.25 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.67 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.69 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  60 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.64 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.96 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.57 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  62.5 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.08 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.95 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.08 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.72 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.47 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  59.05 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.13 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.18 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.62 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  51.16 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  62.5 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.17 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.59 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.43 
 
 		 203 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.41 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  63.41 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  48.18 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.82 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.17 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.14 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.26 
 
 		 163 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  51.65 
 
 		 181 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.74 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  40.88 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.54 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.75 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.45 
 
 		 306 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  42.25 
 
 		 1583 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  34.04 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>