57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4107 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  73.13 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.43 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.97 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  76.47 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  73.63 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.73 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  67.37 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  65.35 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.56 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.27 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.8 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.08 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  60.87 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  63.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.61 
 
 		 203 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  60 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.37 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  66.29 
 
 		 134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  60 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  62.07 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.36 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  48.87 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  46.15 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.82 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  58.82 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  50 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.29 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.83 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.75 
 
 		 253 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.43 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.17 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  58.33 
 
 		 247 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.14 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.13 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  52.04 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.28 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.24 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.67 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.35 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.06 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>