66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5992 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.44 
 
 		 203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.26 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.99 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.53 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  44.53 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.34 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.19 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.96 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  41.18 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.55 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  59.76 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  50.53 
 
 		 138 aa  93.2  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.22 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  43.41 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.16 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.88 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.96 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.21 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.16 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.4 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.48 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.48 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.48 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  47.37 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  43.18 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.74 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.48 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.48 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.5 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.67 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.89 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.68 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.53 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  51.61 
 
 		 181 aa  84.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.26 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.32 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.13 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  41.79 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.48 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  39.68 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.48 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  38.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  37.8 
 
 		 247 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 253 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  37.3 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  32 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  34.88 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  43.64 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  28.29 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  28.29 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  28.29 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  40.32 
 
 		 1583 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  36.11 
 
 		 1639 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  34.48 
 
 		 1131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.93 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  34.55 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>