23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  57.14 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  55.88 
 
 		 1131 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  57.58 
 
 		 1131 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.28 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.83 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  41.88 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.88 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  41.88 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.02 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.64 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  33.05 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.54 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1583 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.62 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.86 
 
 		 111 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  27.42 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.82 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1933  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.92 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  27.04 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>