32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1483 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 157 aa  318  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  51.97 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  46.02 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.1 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.1 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  45.1 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  45.1 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49 
 
 		 195 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.24 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  40.78 
 
 		 1131 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  42 
 
 		 1131 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.58 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  36.84 
 
 		 546 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.78 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.63 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.55 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  43.55 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.92 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  28.37 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.54 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  28.37 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.83 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  35.94 
 
 		 1583 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.94 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.68 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  43.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.42 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>