14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2616 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.85 
 
 		 149 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  53.93 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  44.64 
 
 		 210 aa  94.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  49.47 
 
 		 1131 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  48.42 
 
 		 1131 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  49.45 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  49.45 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.45 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.74 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.24 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  44.23 
 
 		 546 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2042  hypothetical protein  30.87 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.06 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>