44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0946 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.41 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.83 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  31.14 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.24 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.4 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.23 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5434  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.71 
 
 		 349 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.158249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  50 
 
 		 210 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.13 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.97 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.62 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.99 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  32.18 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  39.06 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.84 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  42.03 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  27.88 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  27.88 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  27.88 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.84 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  32.9 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  36.84 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.77 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  35.05 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  31.03 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  31.03 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  31.03 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  34.04 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  34.04 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.42 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1933  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  34.21 
 
 		 140 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  34.04 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.61 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  30.07 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.38 
 
 		 1131 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1583 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  32.98 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  34.04 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0628566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>