64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4680 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4680  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0206  guanyl-specific ribonuclease Sa-like protein  60.58 
 
 
138 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.84603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4760  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  61.11 
 
 
134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2182  ribonuclease  70.37 
 
 
146 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2093  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  70.37 
 
 
146 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0734  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.22 
 
 
156 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5897  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.83 
 
 
151 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1055  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.15 
 
 
146 aa  114  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327789  normal  0.454637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3466  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.61 
 
 
134 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4107  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.61 
 
 
134 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1532  putative Guanyl-specific ribonuclease SA  58.62 
 
 
149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5992  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.44 
 
 
144 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00390  ribonuclease  52 
 
 
146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0633  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  62.2 
 
 
119 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6031  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.56 
 
 
139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.791884  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4859  guanyl-specific ribonuclease SA  62.79 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0462913  normal  0.13807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1168  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.7 
 
 
134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2603  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.78 
 
 
133 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0260395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2670  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  64.2 
 
 
149 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3915  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.33 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5271  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  56.04 
 
 
136 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4699  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  54.02 
 
 
151 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2753  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  49.15 
 
 
143 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.411039  normal  0.82721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1190  ribonuclease SA  60.92 
 
 
143 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0559  putative guanyl-specific ribonuclease signal peptide protein  56.52 
 
 
138 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3396  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  55.43 
 
 
138 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000799345  hitchhiker  0.0033697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0358  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  57.89 
 
 
128 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0533  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.31 
 
 
143 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0094  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  58.82 
 
 
130 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0557  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  48.31 
 
 
143 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4808  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  53.85 
 
 
136 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229472  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1227  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  50.96 
 
 
146 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2986  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.32 
 
 
147 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396787  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0632  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.5 
 
 
143 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0149  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.5 
 
 
143 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3714  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.5 
 
 
143 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0628566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0600  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  47.5 
 
 
143 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809043  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2846  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.22 
 
 
138 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2476  ribonuclease SA  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3310  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3473  ribonuclease SA  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0395  ribonuclease SA  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1255  ribonuclease SA  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3438  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3475  guanyl-specific ribonuclease Sa  57.47 
 
 
143 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0858  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  60.26 
 
 
163 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2766  guanyl-specific ribonuclease precursor signal peptide protein  51.82 
 
 
143 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545726  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3012  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  51.38 
 
 
143 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2602  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  52.88 
 
 
143 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01650  guanyl-specific ribonuclease Sa  52.75 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.858693  normal  0.618031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.88 
 
 
253 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  54.88 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3334  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.77 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.670028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2926  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  45.68 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0658  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  37.63 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  38.81 
 
 
1583 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40 
 
 
306 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.59 
 
 
1131 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  27.42 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  35.59 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0946  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  33.04 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  35.59 
 
 
1131 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40.68 
 
 
157 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5434  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  46.34 
 
 
349 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.158249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>