More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2762 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2762  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2908  hypothetical protein  98.59 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  71.83 
 
 
70 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  67.61 
 
 
70 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  69.12 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  64.79 
 
 
70 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  66.2 
 
 
70 aa  90.5  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.38 
 
 
69 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  61.97 
 
 
70 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.38 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.79 
 
 
70 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.56 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  60.56 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.56 
 
 
71 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.56 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1911  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.97 
 
 
70 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000206161  normal  0.143594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.97 
 
 
70 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4415  cold-shock DNA-binding protein  62.86 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0245079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.56 
 
 
69 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.970454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51840  cold-shock protein  62.69 
 
 
204 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192967  hitchhiker  0.0041484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.56 
 
 
70 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.15 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1263  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 
205 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4547  cold-shock protein  62.69 
 
 
203 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  59.15 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4209  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
197 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17950  Cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.15 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49410  cold-shock protein  59.15 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000191939  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4006  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
197 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4145  cold shock protein CapB  59.15 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3884  cold-shock protein, DNA-binding  59.15 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218294  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1085  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1201  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.15 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1238  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
197 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  60.56 
 
 
69 aa  84.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  60.56 
 
 
70 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2160  cold-shock protein, DNA-binding  60.29 
 
 
70 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233344  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  57.75 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.93 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  61.76 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  61.76 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2376  cold shock domain family protein  58.82 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.85246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  59.15 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  62.69 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
69 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.34 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.56 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  61.76 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2649  cold-shock DNA-binding domain protein  60.56 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139093  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.76 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.76 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.93 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1128  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1099  cold-shock domain-contain protein  60.29 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0660556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1209  cold-shock domain-contain protein  61.76 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953881  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3984  cold shock domain family protein  61.43 
 
 
73 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1403  cold-shock protein, DNA-binding  61.43 
 
 
73 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861967  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1139  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159877  normal  0.955199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4313  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  61.54 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  61.54 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0942  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2609  cold-shock protein, DNA-binding  57.75 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  61.54 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1475  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.75 
 
 
71 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  61.54 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3079  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.34 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000105073  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.76 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.15 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  61.54 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4519  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
66 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  60 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.75 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0752  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000576972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  60.61 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  60.61 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2536  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  63.08 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1855  cold acclimation protein B  57.75 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21760  cold acclimation protein B  57.75 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342335  normal  0.456476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>