More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2039 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  98.55 
 
 		 69 aa  136  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.81 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.27 
 
 		 68 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.46 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 68 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  96.7  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  63.77 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  71.43 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  68.25 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  65.67 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  65.71 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0374  cold-shock DNA-binding domain protein  63.77 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  64.29 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 68 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  66.15 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0244  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  68.57 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.87 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  65.71 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.07 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  64.29 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2354  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.32 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.895038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  70 
 
 		 66 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  62.12 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.24 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  53.62 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  65.67 
 
 		 70 aa  85.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  64.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  63.93 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  63.93 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>