More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0752 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0752  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000576972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
66 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
66 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
67 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 
67 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 
67 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  71.21 
 
 
67 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
67 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 
67 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
66 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
66 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.21 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  71.64 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 
66 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
68 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
68 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  69.7 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  71.21 
 
 
66 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  67.69 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  65.15 
 
 
66 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 
68 aa  93.2  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
68 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
68 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 
71 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  64.18 
 
 
67 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 
67 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 
68 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
68 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
67 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  60.94 
 
 
68 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
68 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  68.18 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  68.18 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0521  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2596  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111063  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1465  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000499386  normal  0.887495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0957427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 
67 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 
77 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
67 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 
69 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>