More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0103 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
67 aa  140  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  92.31 
 
 
67 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  80.6 
 
 
67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.6 
 
 
67 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 
67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
67 aa  114  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 
67 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
67 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
67 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  74.63 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  77.42 
 
 
62 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
67 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
72 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 
68 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
67 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0521  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
68 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
66 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
68 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  65.67 
 
 
68 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
68 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
67 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  66.67 
 
 
67 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
68 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
67 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
67 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  71.88 
 
 
67 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
67 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  67.16 
 
 
79 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 
67 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  67.16 
 
 
67 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
69 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  70.15 
 
 
67 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
65 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  65.15 
 
 
67 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
67 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 
68 aa  98.6  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
66 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  64.62 
 
 
67 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2376  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000357457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
68 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02364  stress response protein CspD  67.19 
 
 
72 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000164326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 
67 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  67.19 
 
 
69 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
66 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  67.19 
 
 
69 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  62.69 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>