More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2494 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.07 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  83.58 
 
 		 67 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 		 67 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.6 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  87.69 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.6 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  87.69 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  87.69 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  80.6 
 
 		 67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.6 
 
 		 67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  80.6 
 
 		 67 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.54 
 
 		 65 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3591  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2602  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0673828  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  70.15 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3528  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00720053  normal  0.332876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0430  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000180464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 		 68 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  71.21 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 		 69 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  69.23 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  65.15 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  65.67 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  64.18 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  64.18 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  69.23 
 
 		 81 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 81 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  59.7 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2568  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000063088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>