More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  100 
 
 		 67 aa  136  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  84.85 
 
 		 67 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  83.33 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.3 
 
 		 67 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  81.25 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 		 67 aa  110  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  81.82 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.82 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  78.12 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  72.73 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  78.12 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  79.69 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  69.7 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 68 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  76.56 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  78.12 
 
 		 67 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7468  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 68 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  75 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  75 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  75 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  71.21 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.21 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.56 
 
 		 65 aa  97.1  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  68.85 
 
 		 62 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  73.44 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 68 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  73.44 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  95.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  62.12 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  71.88 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1188  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.71 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00084266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2466  cold shock-like transcription regulator protein  64.06 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.4868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>