More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3292 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
67 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  97.01 
 
 
67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  95.52 
 
 
67 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  92.54 
 
 
67 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  91.04 
 
 
67 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  89.55 
 
 
67 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  89.55 
 
 
67 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  89.55 
 
 
67 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  83.58 
 
 
67 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  89.23 
 
 
67 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  85.07 
 
 
67 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 
67 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  85.07 
 
 
67 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  86.15 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  86.15 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  86.15 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  83.08 
 
 
65 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
67 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 
66 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 
66 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 
66 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
69 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2894  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
67 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0694911  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  71.64 
 
 
67 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3591  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2602  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0673828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0434  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0408  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0476  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0503  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
67 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
67 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
67 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.21 
 
 
68 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  103  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 
67 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 
67 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  68.66 
 
 
67 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0899  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1853  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1944  hypothetical protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0388  cold shock transcription regulator protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3528  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00720053  normal  0.332876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3078  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0482  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0430  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
67 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000180464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4995  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833631  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1442  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  65.67 
 
 
67 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
67 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  100  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
67 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 
68 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1002  cold-shock domain-contain protein  64.18 
 
 
67 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0586  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 
67 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 
67 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0913  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 
77 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
83 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
67 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
68 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  69.23 
 
 
67 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 
67 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  73.85 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312449  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  65.67 
 
 
68 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 
68 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
68 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1894  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
66 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  hitchhiker  0.000840233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
68 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0676  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197262  normal  0.753603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>