More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0573 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  92.54 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  88.06 
 
 		 67 aa  123  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  86.57 
 
 		 67 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.07 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  80.6 
 
 		 67 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.09 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  83.33 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  85.07 
 
 		 67 aa  114  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  79.1 
 
 		 67 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.12 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  81.54 
 
 		 68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.1 
 
 		 67 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  77.61 
 
 		 67 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  70.15 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  74.63 
 
 		 67 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  74.63 
 
 		 79 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 68 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4077  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2345  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.574294  normal  0.405321 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  73.44 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2735  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  67.74 
 
 		 62 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  95.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0521  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3895  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00627672  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3782  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0399631  normal  0.208523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3333  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  66.15 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  66.15 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5269  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>