More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3141 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.3 
 
 		 67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  77.61 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.76 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  74.24 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  75.76 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 		 67 aa  110  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  74.24 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 67 aa  103  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  75.41 
 
 		 62 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 68 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  68.18 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  100  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  70.31 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07120  cold-shock DNA-binding protein family  68.75 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  69.23 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  68.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  67.19 
 
 		 70 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19390  cold-shock DNA-binding protein family  67.69 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.704539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  69.7 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.6 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3078  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  70.31 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 83 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0913  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  64.06 
 
 		 70 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  71.01 
 
 		 68 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 68 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1188  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00084266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 69 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4477  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>