More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0613 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  85.51 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.51 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  63.77 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  72.06 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  70.15 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  71.64 
 
 		 69 aa  97.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2878  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2740  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 69 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.71 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  64.18 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  65.62 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3156  cold shock-like transcription regulator protein  72.58 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  72.13 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.05 
 
 		 68 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 68 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  62.69 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.02 
 
 		 69 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.41 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5342  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  62.32 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5818  cold-shock DNA-binding protein family  70.31 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  65.67 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0367  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.12569e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 68 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  65.67 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5171  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.515643  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0752  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000576972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  75.41 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  64.29 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 72 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5185  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.77 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  68.25 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215281  normal  0.985957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1310  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00171676  normal  0.537383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  60.94 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  67.19 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 67 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  67.19 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  62.69 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  59.09 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  59.09 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  66.15 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  60.94 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.86 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.86 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>