More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2041 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  98.55 
 
 		 69 aa  136  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.81 
 
 		 69 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.79 
 
 		 68 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.91 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.91 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.46 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.91 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 68 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  63.77 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  69.23 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.12 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  67.14 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  68.25 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  65.71 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  67.14 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.52 
 
 		 69 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  65.71 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.71 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0374  cold-shock DNA-binding domain protein  62.32 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  70 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  57.97 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  60.94 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  60.94 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  53.62 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3523  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.97 
 
 		 70 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.32154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.62 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  65.67 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  66.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  67.14 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  64.62 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.42 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  61.43 
 
 		 70 aa  85.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1523  cold shock protein  56.52 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00439829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  60.94 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0244  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17950  Cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  61.9 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  61.9 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2949  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.42 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>