More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0737 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.01 
 
 		 69 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  74.24 
 
 		 69 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.01 
 
 		 69 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 69 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  71.01 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 68 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 68 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 68 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 68 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 68 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 69 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  72.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  73.85 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 69 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 68 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.12 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.22 
 
 		 69 aa  96.7  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  96.7  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  67.14 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 70 aa  93.2  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  64.29 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  62.86 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  70.49 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  60.87 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.87 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  63.64 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  68.12 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  62.12 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  63.77 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  65.15 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  66.67 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  62.12 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.43 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.33 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  62.86 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  63.24 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  66.67 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  59.09 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  66.13 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  66.67 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  68.33 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  66.67 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2949  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.77 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1165  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 69 aa  87.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>