More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1336 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
68 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  94.12 
 
 
68 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.29 
 
 
68 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.88 
 
 
68 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  77.94 
 
 
68 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.94 
 
 
68 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  81.54 
 
 
69 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.61 
 
 
69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.47 
 
 
68 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
69 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.53 
 
 
68 aa  105  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  77.27 
 
 
69 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
69 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.36 
 
 
69 aa  103  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
69 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.78 
 
 
69 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 
69 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
68 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
68 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
68 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
68 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
69 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
69 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
68 aa  100  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 
69 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
69 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 
69 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 
69 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
69 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
69 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  71.88 
 
 
69 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 
69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 
69 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  70.31 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
69 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4097  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
69 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0272616  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
69 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 
69 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  68.12 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1522  cold shock protein CspA  67.16 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310546  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1127  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.53927  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4202  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713161  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  68.12 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  72.31 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  68.12 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  72.31 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  74.6 
 
 
69 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  69.57 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2949  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 
69 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763354  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  68.12 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  68.12 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  68.25 
 
 
66 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 
69 aa  93.6  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  68.57 
 
 
70 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
69 aa  93.2  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  68.12 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1085  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927739  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  68.12 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  70.59 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  68.85 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0051  cold shock protein  70.59 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  66.13 
 
 
66 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 
71 aa  92  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  68.12 
 
 
69 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  66.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  67.21 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  66.67 
 
 
69 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>