More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0526 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.51 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  67.14 
 
 		 70 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  68.57 
 
 		 70 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  68.57 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  67.14 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  67.16 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  68.57 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001501  cold shock transcriptional regulator CspA  62.86 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.103059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  70 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.14 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 68 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  65.71 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  70.15 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2878  hypothetical protein  62.86 
 
 		 68 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2740  hypothetical protein  62.86 
 
 		 68 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  62.69 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  62.69 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.14 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  65.71 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.57 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3156  cold shock-like transcription regulator protein  67.19 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.12 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1310  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00171676  normal  0.537383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215281  normal  0.985957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 69 aa  90.5  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 68 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  67.16 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5171  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.515643  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 69 aa  90.5  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1911  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000206161  normal  0.143594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  64.18 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  60.29 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  60.29 
 
 		 69 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  64.18 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  60.61 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5185  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.13 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  62.69 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  61.19 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  62.86 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  62.69 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  58.82 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  58.82 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>