More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3621 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  137  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.46 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.57 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  72.46 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 		 68 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 68 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  68.66 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 68 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 68 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.22 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2039  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  96.7  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.12 
 
 		 69 aa  96.7  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  68.57 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0244  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  71.43 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  68.57 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2041  hypothetical protein  65.22 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  60.61 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.77 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.14 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000590  cold shock protein CspA  71.21 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00446829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2949  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.22 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.32 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  64.18 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 68 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  63.64 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  65.71 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  68.18 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  65.71 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 		 68 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.42 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  71.88 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  65.15 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  90.5  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2354  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.77 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.895038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0559  putative cold-shock protein  70.49 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05960  putative cold-shock protein  70.49 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.979044  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.29 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>