More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0726 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  340  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  70.73 
 
 		 165 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 		 165 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 167 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  56.02 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  56.63 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  56.02 
 
 		 164 aa  184  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.02 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  53.66 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  54.88 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  54.76 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  54.14 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  54.66 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  53.89 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  53.01 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  54.43 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  50.3 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  50 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  49.4 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  50.3 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  49.1 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  46.71 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  48.5 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  47.74 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.23 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.87 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  38.99 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  40.97 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  36.99 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.04 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  34.9 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  37.66 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  35.97 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  36.69 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  32.47 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  41.41 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  35.85 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  38.69 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  41.41 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  33.57 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>