More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  61.29 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  64.1 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 160 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  57.99 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  57.14 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  56.25 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  55.49 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  57.23 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  56.36 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  54.37 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  56.88 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  54.66 
 
 		 162 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  54.66 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  55.06 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  53.29 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  51.25 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  48.73 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  51.22 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  47.83 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  45.03 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  47.24 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  46.63 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  46.88 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  44.81 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  41.25 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  39.38 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 153 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 153 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 153 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  37.21 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  37.21 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  34.3 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  34.3 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  37.18 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  36.63 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  35.98 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  33.13 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  35.98 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.67 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  42.42 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  38.51 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  33.13 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  36.54 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>