More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2048 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  333  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  96.95 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  91.41 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  91.41 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  91.41 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  83.44 
 
 		 164 aa  284  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  82.32 
 
 		 164 aa  281  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  69.14 
 
 		 162 aa  225  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  68.52 
 
 		 172 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  62.8 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  56.63 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.41 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  54.82 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  52.15 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  53.42 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  53.16 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  51.23 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  46.43 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  50.3 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  47.9 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  48.19 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  47.31 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  44.85 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  46.63 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  43.83 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  43.83 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  43.83 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  43.83 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  40.12 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  40.49 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  42.59 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  40.85 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  38.65 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  40.12 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.62 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  37.97 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  32.7 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  36.43 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  37.86 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  34.69 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0589  transcription elongation factor GreA  36.03 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  35.56 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  36.76 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  32.05 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  32.48 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  31.68 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  35 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  38.76 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  34.25 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  32.91 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>