More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1064 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 166 aa  337  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  78.79 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  81.21 
 
 		 167 aa  276  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  78.18 
 
 		 166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  71.69 
 
 		 167 aa  250  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  66.46 
 
 		 164 aa  216  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  66.06 
 
 		 162 aa  213  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  62.65 
 
 		 164 aa  204  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  62.18 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  61.21 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  57.49 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  60.84 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  60.24 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  58.68 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  59.24 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  57.86 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  58.02 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  53.61 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  51.79 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  54.66 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  52.38 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 165 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  50.94 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  48.12 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  45.16 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  40.97 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  38.13 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  41.13 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  41.01 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  36.88 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  36.88 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  36.88 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  36.17 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  36.5 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  34.36 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  34.59 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  37.58 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  34.75 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  35.46 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  37.67 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  37.14 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  35.29 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>