More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2635 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  72.5 
 
 		 160 aa  241  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  69.38 
 
 		 160 aa  234  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  71.43 
 
 		 161 aa  234  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  66.88 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  67.11 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  65.58 
 
 		 163 aa  196  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  61.49 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  61.01 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 167 aa  183  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  59.63 
 
 		 164 aa  183  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  58.9 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  58.75 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  59.63 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  56.97 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  58.23 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  55.49 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  56.63 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.72 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  51.9 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  52.5 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  52.8 
 
 		 172 aa  154  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  52.8 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  49.09 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  48.78 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  48.78 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  48.78 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  47.59 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  48.19 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  46.95 
 
 		 164 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  41.67 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  38.93 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  41.3 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  36.08 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  35 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  39.38 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.17 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  39.73 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  36.08 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  35.8 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  32.87 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  34 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  37.89 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  37.89 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  37.89 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  36.76 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  37.23 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  38.69 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>