More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0980 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  60.71 
 
 		 160 aa  194  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  60.48 
 
 		 166 aa  193  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.55 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  57.49 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  61.01 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  56.89 
 
 		 167 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  59.39 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  57.99 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  56.96 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  56.17 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  53.89 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  56.97 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  56.71 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  57.23 
 
 		 161 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  53.01 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  54.76 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  54.72 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 165 aa  151  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  51.25 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  49.11 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  50.93 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  47.2 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.72 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  45.86 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  42.95 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  43.31 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  35.9 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  36.59 
 
 		 157 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  43.07 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  40.49 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  40.36 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  38.41 
 
 		 265 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  40.36 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  37.11 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  41.38 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  37.95 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  37.95 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  37.95 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  38.18 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  37.8 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>