More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_676 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_676  transcription elongation factor  100 
 
 		 265 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00449564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  93.21 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  96.13 
 
 		 156 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 162 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 166 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42 
 
 		 160 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 168 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 163 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  41.5 
 
 		 161 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 175 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 158 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  33.14 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 158 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  42 
 
 		 158 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  38.06 
 
 		 158 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  41.78 
 
 		 158 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 175 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 158 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 160 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 158 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 157 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 160 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 157 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 164 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  40.67 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 167 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 161 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 175 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 157 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 160 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 158 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 174 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 157 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  35.09 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 156 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 158 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 156 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 158 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 157 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  39.46 
 
 		 158 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 157 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 160 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 157 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 160 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 157 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 159 aa  99  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>